Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFNP31947 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFNP31947 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFNP31947 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFNP31947 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFNP31947 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFNP31947 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFNP31947 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFNP31947 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFNP31947 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFNP31947 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFNP31947 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFNP31947 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFNP31947 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFNP31947 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFNP31947 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFNP31947 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFNP31947 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFNP31947 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFNP31947 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFNP31947 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFNP31947 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFNP31947 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SFNP31947 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SFNP31947 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFNP31947 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SFNP31947 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFNP31947 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFNP31947 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFNP31947 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFNP31947 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFNP31947 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFNP31947 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFNP31947 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFNP31947 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFNP31947 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SFNP31947 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFNP31947 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFNP31947 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFNP31947 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SFNP31947 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFNP31947 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFNP31947 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFNP31947 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFNP31947 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFNP31947 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFNP31947 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFNP31947 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFNP31947 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFNP31947 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFNP31947 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFNP31947 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFNP31947 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFNP31947 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFNP31947 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFNP31947 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFNP31947 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFNP31947 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFNP31947 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFNP31947 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFNP31947 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFNP31947 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFNP31947 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFNP31947 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFNP31947 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFNP31947 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SFNP31947 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFNP31947 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFNP31947 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFNP31947 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SFNP31947 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFNP31947 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFNP31947 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SFNP31947 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFNP31947 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFNP31947 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFNP31947 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFNP31947 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFNP31947 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFNP31947 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFNP31947 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFNP31947 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFNP31947 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFNP31947 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFNP31947 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFNP31947 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFNP31947 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFNP31947 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SFNP31947 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFNP31947 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFNP31947 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFNP31947 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFNP31947 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFNP31947 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFNP31947 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFNP31947 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFNP31947 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFNP31947 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFNP31947 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFNP31947 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms