Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BMP3P12645 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BMP3P12645 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BMP3P12645 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BMP3P12645 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BMP3P12645 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BMP3P12645 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BMP3P12645 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BMP3P12645 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BMP3P12645 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BMP3P12645 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BMP3P12645 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BMP3P12645 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BMP3P12645 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BMP3P12645 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BMP3P12645 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BMP3P12645 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BMP3P12645 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BMP3P12645 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BMP3P12645 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BMP3P12645 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BMP3P12645 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BMP3P12645 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BMP3P12645 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BMP3P12645 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BMP3P12645 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BMP3P12645 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BMP3P12645 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BMP3P12645 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BMP3P12645 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BMP3P12645 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BMP3P12645 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BMP3P12645 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BMP3P12645 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BMP3P12645 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BMP3P12645 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BMP3P12645 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BMP3P12645 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BMP3P12645 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BMP3P12645 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BMP3P12645 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BMP3P12645 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BMP3P12645 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BMP3P12645 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BMP3P12645 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BMP3P12645 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BMP3P12645 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BMP3P12645 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BMP3P12645 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BMP3P12645 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BMP3P12645 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BMP3P12645 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BMP3P12645 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BMP3P12645 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BMP3P12645 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BMP3P12645 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BMP3P12645 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BMP3P12645 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BMP3P12645 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BMP3P12645 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BMP3P12645 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BMP3P12645 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BMP3P12645 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BMP3P12645 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BMP3P12645 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BMP3P12645 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BMP3P12645 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BMP3P12645 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BMP3P12645 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BMP3P12645 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BMP3P12645 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BMP3P12645 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BMP3P12645 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BMP3P12645 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BMP3P12645 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BMP3P12645 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BMP3P12645 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BMP3P12645 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BMP3P12645 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BMP3P12645 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BMP3P12645 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BMP3P12645 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BMP3P12645 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BMP3P12645 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BMP3P12645 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BMP3P12645 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BMP3P12645 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BMP3P12645 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BMP3P12645 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BMP3P12645 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BMP3P12645 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BMP3P12645 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BMP3P12645 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BMP3P12645 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BMP3P12645 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BMP3P12645 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BMP3P12645 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BMP3P12645 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BMP3P12645 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BMP3P12645 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms