Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms