Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms