Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms