Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.5 ms