Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.1 ms