Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC20■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC20■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC20■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC20■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC20■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms