Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ5

CLIP3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, humanhuman

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Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP3Q96DZ5 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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CLIP3Q96DZ5 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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CLIP3Q96DZ5 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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CLIP3Q96DZ5 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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