Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 Metazoa_SRP.12-201ENST00000553249 268 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms