Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP13Q92995 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP13Q92995 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP13Q92995 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP13Q92995 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
USP13Q92995 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP13Q92995 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP13Q92995 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP13Q92995 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP13Q92995 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP13Q92995 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP13Q92995 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP13Q92995 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP13Q92995 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
USP13Q92995 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP13Q92995 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP13Q92995 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP13Q92995 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP13Q92995 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP13Q92995 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP13Q92995 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP13Q92995 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP13Q92995 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP13Q92995 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP13Q92995 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP13Q92995 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP13Q92995 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP13Q92995 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP13Q92995 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP13Q92995 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP13Q92995 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP13Q92995 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP13Q92995 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP13Q92995 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP13Q92995 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP13Q92995 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP13Q92995 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP13Q92995 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP13Q92995 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP13Q92995 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP13Q92995 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
USP13Q92995 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP13Q92995 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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USP13Q92995 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP13Q92995 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
USP13Q92995 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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USP13Q92995 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP13Q92995 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
USP13Q92995 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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USP13Q92995 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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USP13Q92995 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
USP13Q92995 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP13Q92995 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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USP13Q92995 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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USP13Q92995 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP13Q92995 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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USP13Q92995 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP13Q92995 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP13Q92995 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP13Q92995 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP13Q92995 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP13Q92995 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP13Q92995 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP13Q92995 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP13Q92995 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP13Q92995 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP13Q92995 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP13Q92995 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP13Q92995 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP13Q92995 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP13Q92995 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP13Q92995 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP13Q92995 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP13Q92995 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP13Q92995 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
USP13Q92995 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP13Q92995 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP13Q92995 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP13Q92995 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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