Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms