Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms