Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 PAXIP1-AS2-201ENST00000397551 1692 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 SCARNA7-201ENST00000458797 330 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 C14orf159-210ENST00000518665 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 ZNF569-205ENST00000589833 762 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 ASNSD1-208ENST00000607690 535 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC245519.2-201ENST00000633673 475 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC025287.4-201ENST00000640173 1240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms