Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.7 ms