Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 U73169.1-201ENST00000395152 367 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 CYP4F29P-202ENST00000428301 1279 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 LINC01693-202ENST00000430123 357 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 AC106789.1-201ENST00000512927 570 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 GLT8D2-204ENST00000547583 862 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 ZFAS1-208ENST00000618800 597 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 AC024405.2-201ENST00000528459 810 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 AC007292.1-201ENST00000594444 746 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 MRPS31P4-202ENST00000613769 583 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 CBR3-AS1-210ENST00000623484 392 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 CBR3-AS1-215ENST00000624086 594 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 DAP3-201ENST00000343043 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 CCL17-201ENST00000219244 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 FXYD2-202ENST00000292079 571 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 OR6S1-201ENST00000320704 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 FTH1P18-201ENST00000412071 549 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 AC093106.1-201ENST00000437271 352 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 KRT19P4-201ENST00000443208 943 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 RN7SL523P-201ENST00000484401 298 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 RPSAP70-201ENST00000504462 864 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 AC009120.2-205ENST00000561921 490 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 RN7SL480P-201ENST00000581481 294 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 IFNL3P1-201ENST00000595082 501 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 AC011483.3-201ENST00000601506 826 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 AC008555.6-201ENST00000605047 458 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 UCN3-201ENST00000380433 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 AC103563.2-201ENST00000442200 597 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 AC099328.1-201ENST00000498809 1030 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 SPRY4-AS1-206ENST00000515288 539 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 RN7SL478P-201ENST00000584358 298 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms