Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms