Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms