Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ME1P48163 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ME1P48163 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ME1P48163 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ME1P48163 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ME1P48163 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ME1P48163 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ME1P48163 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ME1P48163 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ME1P48163 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ME1P48163 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ME1P48163 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ME1P48163 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ME1P48163 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ME1P48163 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ME1P48163 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ME1P48163 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ME1P48163 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ME1P48163 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ME1P48163 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ME1P48163 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ME1P48163 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ME1P48163 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ME1P48163 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ME1P48163 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ME1P48163 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ME1P48163 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ME1P48163 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ME1P48163 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ME1P48163 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ME1P48163 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ME1P48163 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ME1P48163 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ME1P48163 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ME1P48163 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ME1P48163 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ME1P48163 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ME1P48163 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ME1P48163 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ME1P48163 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ME1P48163 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ME1P48163 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ME1P48163 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ME1P48163 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ME1P48163 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ME1P48163 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ME1P48163 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ME1P48163 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ME1P48163 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ME1P48163 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ME1P48163 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ME1P48163 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ME1P48163 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ME1P48163 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ME1P48163 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ME1P48163 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ME1P48163 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ME1P48163 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ME1P48163 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ME1P48163 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ME1P48163 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ME1P48163 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ME1P48163 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ME1P48163 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ME1P48163 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ME1P48163 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ME1P48163 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ME1P48163 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ME1P48163 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ME1P48163 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ME1P48163 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ME1P48163 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ME1P48163 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ME1P48163 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ME1P48163 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ME1P48163 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ME1P48163 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ME1P48163 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ME1P48163 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ME1P48163 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ME1P48163 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ME1P48163 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ME1P48163 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ME1P48163 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ME1P48163 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ME1P48163 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ME1P48163 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ME1P48163 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ME1P48163 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ME1P48163 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ME1P48163 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ME1P48163 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ME1P48163 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ME1P48163 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ME1P48163 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ME1P48163 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ME1P48163 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ME1P48163 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ME1P48163 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ME1P48163 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms