Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms