Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 SPATA22-201ENST00000268981 1280 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 CCL20-202ENST00000409189 839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 AL035658.1-201ENST00000415054 357 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 AC078785.2-201ENST00000462010 1253 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 AC092656.1-202ENST00000515843 998 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 AC018607.1-201ENST00000518552 673 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 AC007922.2-201ENST00000579049 281 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 AC026254.4-201ENST00000581118 454 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 AC010615.2-205ENST00000599993 929 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 TSN-202ENST00000409193 1436 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 C4orf22-201ENST00000358105 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 AC117434.1-201ENST00000419971 836 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 AC069540.1-201ENST00000446320 988 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 COX7A2L-204ENST00000463055 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB1P14653 AC111000.5-201ENST00000506559 1178 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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