Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI63

KRTAP20-1, Keratin-associated protein 20-1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-1Q3LI63 HMGN1P4-201ENST00000419500 290 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 AL355490.2-201ENST00000422848 548 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 AC073346.1-201ENST00000441928 651 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 LINC01231-201ENST00000452746 886 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 AL121929.1-201ENST00000457120 524 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 RN7SL76P-201ENST00000482435 289 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 AC024940.2-201ENST00000495623 606 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 MEF2BNBP1-201ENST00000502742 330 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 AC025178.1-201ENST00000503441 834 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 ARL15-205ENST00000507646 578 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 LINC01194-203ENST00000513051 670 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 AC109466.1-201ENST00000517508 804 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 ODF3-203ENST00000525282 764 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 GOLT1B-206ENST00000542038 933 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 MRPL51-205ENST00000543164 814 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 MRPL51-206ENST00000543703 441 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 AC034102.7-201ENST00000550840 470 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 AC040977.2-201ENST00000572547 498 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 ARL16-207ENST00000573392 869 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 AL355353.1-201ENST00000604014 330 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 AP000553.1-201ENST00000610143 430 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 AC027348.1-201ENST00000615979 615 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 NOP16-210ENST00000619979 963 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 DDX41-218ENST00000625286 150 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 DDX41-219ENST00000629036 606 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 AL160408.6-201ENST00000632063 1257 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 LIAS-210ENST00000638451 1159 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 BIN3-212ENST00000640731 450 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF669-204ENST00000448299 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 AL078645.2-201ENST00000245811 1325 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 FKBP4P2-201ENST00000598909 1371 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 TEX101-203ENST00000602198 1446 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 BX088651.4-202ENST00000428895 1479 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 IGHE-202ENST00000641420 1485 ntAPPRIS P5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 LINC01115-202ENST00000621134 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 SLC25A18-202ENST00000399813 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 CMIP-211ENST00000621537 4000 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms