Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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