Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 AL513283.1-201ENST00000441790 1087 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 AC004672.2-201ENST00000537181 574 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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LAPTM4AQ15012 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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LAPTM4AQ15012 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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LAPTM4AQ15012 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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LAPTM4AQ15012 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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LAPTM4AQ15012 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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LAPTM4AQ15012 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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LAPTM4AQ15012 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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