Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms