Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms