Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms