Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms