Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 VAV1-207ENST00000599806 2717 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 GPC4-201ENST00000370828 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 KNDC1-202ENST00000368571 3925 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 EHD1-213ENST00000621096 3336 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 HYOU1-217ENST00000612687 4360 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 CACNB1-202ENST00000394303 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 EME1-202ENST00000393271 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 DACH2-201ENST00000373125 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 COG4-202ENST00000393612 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 MICAL1-208ENST00000630715 3678 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 ZDHHC7-201ENST00000313732 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 C17orf53-202ENST00000319977 2725 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 ANTXR2-203ENST00000403729 8273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 INPP5J-201ENST00000331075 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 IP6K3-201ENST00000293756 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 CLU-202ENST00000405140 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 POTEI-203ENST00000631234 2072 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms