Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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