Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5N7

LPCAT2, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT2Q7L5N7 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPCAT2Q7L5N7 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms