Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms