Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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COL24A1Q17RW2 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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COL24A1Q17RW2 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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COL24A1Q17RW2 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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COL24A1Q17RW2 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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COL24A1Q17RW2 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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COL24A1Q17RW2 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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COL24A1Q17RW2 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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