Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CKAP5Q14008 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CKAP5Q14008 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CKAP5Q14008 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CKAP5Q14008 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CKAP5Q14008 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CKAP5Q14008 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CKAP5Q14008 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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