Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms