Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
HBBP68871 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
HBBP68871 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
HBBP68871 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.28□□□□□ -0.6
HBBP68871 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
HBBP68871 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
HBBP68871 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
HBBP68871 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
HBBP68871 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
HBBP68871 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
HBBP68871 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
HBBP68871 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
HBBP68871 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.6
HBBP68871 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
HBBP68871 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
HBBP68871 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
HBBP68871 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
HBBP68871 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
HBBP68871 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
HBBP68871 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
HBBP68871 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
HBBP68871 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
HBBP68871 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
HBBP68871 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
HBBP68871 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
HBBP68871 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
HBBP68871 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
HBBP68871 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
HBBP68871 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HBBP68871 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
HBBP68871 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
HBBP68871 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HBBP68871 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HBBP68871 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HBBP68871 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
HBBP68871 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HBBP68871 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
HBBP68871 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
HBBP68871 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
HBBP68871 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HBBP68871 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
HBBP68871 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
HBBP68871 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
HBBP68871 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
HBBP68871 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
HBBP68871 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
HBBP68871 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
HBBP68871 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
HBBP68871 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HBBP68871 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
HBBP68871 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
HBBP68871 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
HBBP68871 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
HBBP68871 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
HBBP68871 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HBBP68871 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
HBBP68871 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
HBBP68871 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HBBP68871 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HBBP68871 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
HBBP68871 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HBBP68871 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HBBP68871 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
HBBP68871 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
HBBP68871 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
HBBP68871 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HBBP68871 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
HBBP68871 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HBBP68871 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HBBP68871 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
HBBP68871 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
HBBP68871 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HBBP68871 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HBBP68871 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HBBP68871 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HBBP68871 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HBBP68871 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HBBP68871 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HBBP68871 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HBBP68871 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HBBP68871 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HBBP68871 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HBBP68871 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HBBP68871 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HBBP68871 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HBBP68871 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HBBP68871 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HBBP68871 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HBBP68871 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HBBP68871 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HBBP68871 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HBBP68871 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HBBP68871 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HBBP68871 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HBBP68871 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HBBP68871 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HBBP68871 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HBBP68871 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HBBP68871 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
HBBP68871 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms