Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms