Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BMP3P12645 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BMP3P12645 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BMP3P12645 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
BMP3P12645 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BMP3P12645 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BMP3P12645 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BMP3P12645 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BMP3P12645 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BMP3P12645 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
BMP3P12645 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BMP3P12645 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BMP3P12645 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BMP3P12645 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BMP3P12645 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BMP3P12645 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BMP3P12645 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BMP3P12645 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BMP3P12645 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BMP3P12645 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BMP3P12645 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BMP3P12645 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BMP3P12645 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BMP3P12645 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BMP3P12645 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BMP3P12645 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BMP3P12645 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BMP3P12645 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BMP3P12645 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BMP3P12645 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BMP3P12645 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BMP3P12645 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BMP3P12645 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BMP3P12645 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BMP3P12645 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BMP3P12645 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BMP3P12645 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BMP3P12645 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BMP3P12645 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BMP3P12645 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BMP3P12645 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BMP3P12645 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
BMP3P12645 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
BMP3P12645 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BMP3P12645 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
BMP3P12645 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BMP3P12645 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
BMP3P12645 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BMP3P12645 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BMP3P12645 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BMP3P12645 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BMP3P12645 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BMP3P12645 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BMP3P12645 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BMP3P12645 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BMP3P12645 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
BMP3P12645 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BMP3P12645 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BMP3P12645 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BMP3P12645 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BMP3P12645 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BMP3P12645 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BMP3P12645 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BMP3P12645 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BMP3P12645 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BMP3P12645 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BMP3P12645 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BMP3P12645 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BMP3P12645 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BMP3P12645 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BMP3P12645 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BMP3P12645 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP3P12645 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP3P12645 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP3P12645 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP3P12645 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP3P12645 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP3P12645 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP3P12645 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP3P12645 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP3P12645 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP3P12645 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP3P12645 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP3P12645 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP3P12645 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP3P12645 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP3P12645 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP3P12645 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP3P12645 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP3P12645 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP3P12645 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP3P12645 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP3P12645 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP3P12645 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP3P12645 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP3P12645 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP3P12645 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP3P12645 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP3P12645 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP3P12645 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms