Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLI2P10070 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLI2P10070 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLI2P10070 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLI2P10070 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLI2P10070 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GLI2P10070 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLI2P10070 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLI2P10070 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GLI2P10070 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLI2P10070 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLI2P10070 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GLI2P10070 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLI2P10070 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLI2P10070 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GLI2P10070 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLI2P10070 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI2P10070 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI2P10070 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI2P10070 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI2P10070 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI2P10070 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI2P10070 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI2P10070 AC006986.1-201ENST00000612764 241 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI2P10070 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI2P10070 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI2P10070 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI2P10070 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI2P10070 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI2P10070 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI2P10070 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI2P10070 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI2P10070 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI2P10070 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI2P10070 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI2P10070 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI2P10070 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI2P10070 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI2P10070 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI2P10070 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI2P10070 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI2P10070 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI2P10070 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI2P10070 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI2P10070 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GLI2P10070 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GLI2P10070 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GLI2P10070 KIR2DL4-207ENST00000396293 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GLI2P10070 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GLI2P10070 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GLI2P10070 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GLI2P10070 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GLI2P10070 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GLI2P10070 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GLI2P10070 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GLI2P10070 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GLI2P10070 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GLI2P10070 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GLI2P10070 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GLI2P10070 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GLI2P10070 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GLI2P10070 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GLI2P10070 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GLI2P10070 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GLI2P10070 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GLI2P10070 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
GLI2P10070 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GLI2P10070 PYM1-203ENST00000408946 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GLI2P10070 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
GLI2P10070 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
GLI2P10070 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
GLI2P10070 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GLI2P10070 HCG18-241ENST00000602290 821 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GLI2P10070 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
GLI2P10070 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GLI2P10070 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GLI2P10070 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI2P10070 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI2P10070 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI2P10070 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI2P10070 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI2P10070 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI2P10070 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI2P10070 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI2P10070 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI2P10070 C22orf42-201ENST00000382097 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI2P10070 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI2P10070 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI2P10070 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI2P10070 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI2P10070 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI2P10070 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI2P10070 HNRNPA1P25-201ENST00000422644 937 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI2P10070 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI2P10070 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI2P10070 AC011431.1-201ENST00000512971 230 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI2P10070 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI2P10070 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI2P10070 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI2P10070 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms