Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC18■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC18■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC18■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC18■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC18■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR3DP05423 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms