Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms