Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms