Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUE0

ZDHHC18, Palmitoyltransferase ZDHHC18, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC18Q9NUE0 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC18Q9NUE0 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms