Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms