Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms