Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms