Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXT8

ALKAL1, ALK and LTK ligand 1, humanhuman

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKAL1Q6UXT8 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALKAL1Q6UXT8 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms