Protein–RNA interactions for Protein: Q13630

TSTA3, GDP-L-fucose synthase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3Q13630 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms