Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATRQ13535 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATRQ13535 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATRQ13535 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATRQ13535 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATRQ13535 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATRQ13535 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATRQ13535 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATRQ13535 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATRQ13535 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATRQ13535 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATRQ13535 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ATRQ13535 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATRQ13535 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ATRQ13535 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATRQ13535 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATRQ13535 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATRQ13535 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ATRQ13535 BX088651.3-201ENST00000418155 352 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ATRQ13535 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATRQ13535 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATRQ13535 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ATRQ13535 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATRQ13535 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATRQ13535 AC140847.2-201ENST00000545923 501 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATRQ13535 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATRQ13535 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ATRQ13535 EEF1DP7-201ENST00000580496 513 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ATRQ13535 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATRQ13535 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATRQ13535 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATRQ13535 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ATRQ13535 HIST1H3B-201ENST00000621411 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATRQ13535 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATRQ13535 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATRQ13535 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATRQ13535 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATRQ13535 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATRQ13535 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ATRQ13535 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATRQ13535 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATRQ13535 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATRQ13535 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ATRQ13535 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATRQ13535 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATRQ13535 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATRQ13535 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATRQ13535 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATRQ13535 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATRQ13535 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ATRQ13535 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATRQ13535 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATRQ13535 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATRQ13535 MACROD2-204ENST00000407045 727 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATRQ13535 HNRNPA1P25-201ENST00000422644 937 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ATRQ13535 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATRQ13535 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATRQ13535 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATRQ13535 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATRQ13535 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ATRQ13535 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATRQ13535 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATRQ13535 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATRQ13535 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATRQ13535 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATRQ13535 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATRQ13535 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATRQ13535 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATRQ13535 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATRQ13535 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATRQ13535 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATRQ13535 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATRQ13535 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATRQ13535 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATRQ13535 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATRQ13535 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ATRQ13535 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATRQ13535 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATRQ13535 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATRQ13535 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATRQ13535 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATRQ13535 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATRQ13535 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATRQ13535 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATRQ13535 SIGLEC20P-201ENST00000595243 1311 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ATRQ13535 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATRQ13535 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATRQ13535 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATRQ13535 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATRQ13535 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATRQ13535 KIR2DL4-207ENST00000396293 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATRQ13535 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ATRQ13535 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATRQ13535 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATRQ13535 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATRQ13535 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ATRQ13535 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATRQ13535 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATRQ13535 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATRQ13535 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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