Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TROQ12816 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TROQ12816 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TROQ12816 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TROQ12816 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TROQ12816 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TROQ12816 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TROQ12816 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TROQ12816 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TROQ12816 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TROQ12816 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TROQ12816 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TROQ12816 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TROQ12816 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TROQ12816 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TROQ12816 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TROQ12816 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TROQ12816 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TROQ12816 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TROQ12816 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TROQ12816 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TROQ12816 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TROQ12816 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TROQ12816 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TROQ12816 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TROQ12816 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TROQ12816 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TROQ12816 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TROQ12816 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TROQ12816 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TROQ12816 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TROQ12816 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TROQ12816 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TROQ12816 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TROQ12816 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TROQ12816 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TROQ12816 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TROQ12816 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TROQ12816 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TROQ12816 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TROQ12816 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TROQ12816 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TROQ12816 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TROQ12816 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TROQ12816 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TROQ12816 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TROQ12816 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TROQ12816 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TROQ12816 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TROQ12816 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TROQ12816 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TROQ12816 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TROQ12816 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TROQ12816 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TROQ12816 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TROQ12816 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TROQ12816 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TROQ12816 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TROQ12816 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TROQ12816 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TROQ12816 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TROQ12816 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TROQ12816 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TROQ12816 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TROQ12816 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TROQ12816 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TROQ12816 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TROQ12816 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TROQ12816 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TROQ12816 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TROQ12816 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TROQ12816 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TROQ12816 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TROQ12816 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TROQ12816 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TROQ12816 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TROQ12816 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TROQ12816 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TROQ12816 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TROQ12816 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TROQ12816 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TROQ12816 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TROQ12816 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TROQ12816 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TROQ12816 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TROQ12816 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TROQ12816 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TROQ12816 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TROQ12816 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TROQ12816 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TROQ12816 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TROQ12816 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TROQ12816 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TROQ12816 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TROQ12816 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TROQ12816 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TROQ12816 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TROQ12816 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TROQ12816 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TROQ12816 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
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